Den hälsokontroll som fastställs för aviär influensa av de behöriga enheterna är inte bara kopplad till den ekonomiska påverkan som härrör från djursdöd, utan ger också upphov till särskilda farhågor för folkhälsan . Vad som är mest oroliga för experter är att nya virala subtyper kan orsaka sjukdom hos människor och framför allt att överföras från person till person. Influensavirus som hör till typ A, genomgår faktiskt fenomen av genetisk omfördelning med hög frekvens; Detta möjliggör en anmärkningsvärd kapacitet för anpassning till nya gäster och bestämmer det kontinuerliga utseendet på nya virala stammar . Dessa mutationer kan inträffa, till exempel när ett humant virus och ett aviärt virus "utbyter" sitt genetiska arv eller när viruset passerar från en djurart till en annan (passagen från fåglar till gris är särskilt farlig). Det finns därför möjligheten att från en djurtank kunna härleda ett nytt virus för vilket människan är mottaglig (som hände i förra seklet, till exempel med spanska från virus A-H1N1 från 1919 eller asiatiska från A-H2N2 av 1957).
Den eventuella överföringen mellan människor skulle göra det möjligt för sjukdomen att sprida sig globalt och därigenom orsaka en influensapandemi . För närvarande förblir virusen med den högsta pandemiska potentialen H5N1 och H7N9 eftersom de fortsätter att cirkulera bland kycklingar och kan orsaka allvarlig sjukdom hos människor. Andra virusundertyper kan utlösa en pandemi, men risken anses vara lägre.
