Marburgviruset har sitt namn från den tyska staden med samma namn, där den först uppträdde 1967, då det orsakade tre samtidiga utbrott i Tyskland (städerna Marburg och Frankfurt) och i före detta Jugoslavien (Belgrad). I båda länderna introducerades Marburg-viruset förmodligen med import av ugandiska gröna apor ( Cercopithecus aethiops, även känd som grågrön Cercopiteco).
De första fallen registrerades bland laboratoriepersonal i nära kontakt med dessa primater. Sekundärfall involverade medicinsk personal på sjukhus utsatta för infekterat biologiskt material.
Därefter registrerades sporadiska episoder eller utbrott i Sydafrika, Kenya, Demokratiska republiken Kongo och Angola, för totalt 600 fall och 480 dödsfall.
