För närvarande är ett vaccin eller ett läkemedel för profylax mot afrikansk trypanosomiasis inte tillgängligt. Förebyggande åtgärder syftar därför till att minimera kontakten med ts-fluga.
För det första bör de infekterade områdena undvikas. Tsetsefloden är mindre aktiv under dagens hetaste timmar, men kan angripa om det är irriterat. Man bör komma ihåg att denna insekt lockas till rörliga föremål och ljusa eller mörka färger; han kan också sticka med lätta kläder. Det är därför rekommenderat att ha på sig skjortor och byxor som täcker extremiteterna så mycket som möjligt. i synnerhet kläder av resistent material och neutrala färger som blandar sig med miljön är att föredra. Appliceringen av repellenter på kläder kan också vara användbar. Svärm av ts-fluga kan följa flyttbara fordon, så det är att föredra att stänga bilfönstren för att förhindra att de invaderar stugan.
Kampen mot vektorsektorn kan genomföras på miljönivå med förstörelse av livsmiljöer för reproduktion, användning av insekticider och fällor (bättre om impregnerade med permetrin) i skyddsområdena för ts-fluga (savanskrubb) och vegetation längs vattendrag) och behandling av de parasiterade ämnena (infektionskälla för bärarna).
