Diagnosen av afrikansk trypanosomiasis måste övervägas hos alla personer som har bott i områden i Afrika som anses vara riskerade för sjukdomen.
Den första etappen av sömnsjukdom är svår att diagnostisera, eftersom det orsakar icke-specifika symptom, såsom feber och svaghet. Metoder som används för direktidentifiering av trypanosomer innefattar analysen genom ljusmikroskopi av blodprover (smet eller tjock droppe) eller lymfkörtel aspiration. Andra icke-specifika laboratorieresultat visar pancytopeni, ökad VES och PCR och förhöjda IgM-nivåer.
När parasiten invaderar centrala nervsystemet och patienter börjar manifestera neurologiska och psykiatriska symtom (dålig motorisk koordinering, desorientering, kramp och sömnstörningar) kräver diagnosbedömningen analys av ett prov av cerebrospinalvätska . Undersökningen av vätskan gör det möjligt att isolera trypanosomerna och markera höga halter av lymfocyter, totala proteiner, en markant ökning av IgM och de karakteristiska Mott-cellerna (plasmaceller med cytoplasmatiska vakuoler innehållande immunoglobuliner).
